为什么我们可以从基因序列上追溯新冠肺炎的传染源 并在新冠肺炎检测到该基因？

新冠肺炎目前处于全球疫情。一定有人在想，病毒的基因序列是什么？它如何帮助专家确定传染源？

作为一个理工男，我想通过“藏在办公室窗前的秘密”帮助你了解基因是如何起作用的，通过“神秘字母”告诉你基因是如何遗传和变异的。最后，你将理解新冠肺炎的基因序列如何帮助确定传染源。

隐藏在服务窗口前的秘密这是一个行政服务中心。你坐在靠窗的椅子上，准备处理事情。但是你突然离开椅子站了起来。你低下头(试图靠近隔断玻璃上的窗户)，弯下腰，还没有，腿弯了一点。嗯，你确认了整个姿势的正确性，然后你一直保持这个姿势，直到作品结束。

伴随着整个做事过程，你做了一件你自己都没有意识到的事情：你完成了一个由“弓和弓”基因片段控制的标准动作！

“基因片段”是我的词，它其实是一个物理设施，关键部分是椅子和玻璃窗的组合！这个设施可以唤起人的感知和反馈，所以这个设施可以控制人。我称之为“基因片段”，是因为它和生物基因片段一样，由于自身的结构而具有控制事物的能力，能够促使目标做出相应的确定动作。这个“鞠躬鞠躬”的基因片段决定了你要做上述“鞠躬鞠躬”的动作，对其他人也大致如此。

这个“弓和弓”基因片段的组合稍微变异，玻璃窗的高度就向上调整了。新的基因片段突变成功，这个新的基因片段会控制你完成“被平等”的标准动作。

无论是“低头弓背”还是“平起平坐”，参与者都是不由自主的，都是由椅子和窗户的组合来控制的。这种组合包含了特定的程序信息，对应着受影响的对象要做出的指定动作，而这种程序信息就是这种物理结构的功能归纳和命名。

在生物细胞和病毒中，具有控制行为功能的物质设施是DNA大分子，DNA分子上的程序信息称为“基因”，DNA上的功能片段称为基因片段。基因通过有机大分子的结构、离子的电场和化学键及其组合作用于细胞液中的化学离子和分子，从而在分子水平上完成相应的动作。细胞和病毒的惊人行为，不过是按照遗传程序信息一步一步的行动。

人们常常把“基因”和“遗传”这两个词联系在一起。其实把“基因”和“控制”这两个词连在一起比较好，“遗传”也是“控制”的一种。

有些人似乎认为椅子和窗户的组合所控制的运动是没有意义的。但什么是“意义”？生活的微观细节和“鞠躬鞠躬”的动作一样，本身没有意义。“意义”只能通过宏观效果来呈现，也是依附于人的意识和思维的。落花无情，流水无心，人类是有各种情感的。如果你坚持意义，行动的唯一意义就是存在，而不是它本身。

当然，把椅子和windows基因片段的结合称为牵强附会。只论证了基因功能的原理，不能论证基因的遗传和变异。下面这封“神秘的信”会让你知道什么是遗传和变异。

神秘的信”(一)你好，新冠肺炎已经风靡全球两年了。为了遏制其流行，世界三大密宗联合发起了一项活动。信不信由你，它有神奇的力量。请将这封信复印五份。每封信都装在一个绿色的中号信封里，中间写着“神奇的转折”。你偷偷给同事朋友亲戚发了五封新信。如果他们像你一样读这封信，你的功德将是完整的，你将不会倾向于新冠肺炎。(c)记住，如果你收到这封信却不转发，你会.不要怀疑这个世界有神奇的力量。我们人类知识太少了！记住！记住！"

熟悉吗？在手机和网络普及之前，这种吉利又安全的信已经流行过很多次了。现在，各种微信群里都有类似的幸运平安的消息。

不要小看这封信，它的流行特征和新冠肺炎高度相似！把这封信称为病毒也不为过。让我们简单地看一下细胞和新冠肺炎，然后看看这封信是如何类似于新冠肺炎。

动物和植物的细胞和病毒中都有DNA(或RNA)分子。DNA(或RNA)分子由控制生化反应的基因序列排列而成。在基因序列的控制下，细胞内发生一系列生化反应，维持细胞和病毒的生存。这些作用还可以使细胞分裂成两个相同的细胞，使细胞数量翻倍。病毒比细胞小，寄生在生物细胞中。它们的繁殖是通过复制而不是裂变产生的。各种生物的基因不同，所以基因控制的微观动作也不同，导致各种生物的宏观特征不同，表现出很大的多样性。

新冠肺炎可以简化为外壳和内核。外壳是凸起的蛋白质包膜，内核主要是携带基因序列的RNA分子。新冠肺炎寄生在人体细胞中，它可以复制新的病毒，就像它自己在细胞液中一样。新冠肺炎外貌和特征的秘密在于它的基因。复制它的基因产生一种新的病毒，这种病毒自然和原来的病毒是一样的。

如果把上面那封神秘的信看作是新冠肺炎，那么信的信封就是外壳，里面的信纸就是RNA，信纸上的文字序列就是基因序列。信的特点是：绿色中号，中间是“神奇的转折点”字样，信纸上的字是“你好，新冠肺炎风靡全球2年了.记住！记住！"。这封信的上述特征是由其自身基因决定的，具体来说就是信纸上的文字序列。字母的另一个特点是繁殖速度快，后代和他一样高。生殖的行为也是由其自身的基因决定的，也就是文本序列。

这种信可以被人类感知和反馈，可以控制人做出相应的动作。在人类行动的帮助下，字母可以存活并迅速繁殖。这封流行信的寄生环境是一个多疑胆小的人类社会。新冠肺炎寄生在生物细胞中，其存活和大量繁殖的原理与此信相似，但它们的组成材料和寄生环境不同，基因控制的作用也不同。

遗传和变异显然，大多数新字母与旧字母高度相同，这就是所谓的“遗传”。

但在字母复制的过程中，字母的基因可能会出错：比如不小心把“绿”字写成了“红”字，于是发生了“突变”，这个突变字母的后代就是红包。我们把(b)段中“绿”字所在的第22个位置称为突变点，它使后代的特征发生极其显著的变化。如果(b)段第14段的位置突然发生变化，比如“5”变成了“9”，那么这个分支的信件流转速度会比以前快很多倍；相反，如果“5”突然变成了“1”，就可能导致这个分支的字母泛滥戛然而止。

当然，如果将(b)段第一个位置的“请”字改为“清”，对信件的流转不会有太大影响。也许，“清”字很快就会改成“请”，因为从“清”变成“请”的概率极高。还有一些关键位置的变化是致命的。比如(a)段，第12位的“2”变成了“8”，收信人觉得这个字母太不靠谱，就丢弃了。用生物学术语来说，这个变异分支不能适应环境，自然被淘汰。

总之，这种字母流行一段时间后，可能会有以下几种字母同时流通：原、清、9、1、红。

检测基因序列确定传染源现在我们来关注一个山村。一半的村民收到了新冠肺炎的来信。基因测序显示，大部分是原始人和“9”型，少数是“红”型。

一天，一个村民收到了一封“1”的信。很明显，这封信不是我们村的。而且全球“1”型只有少数城市有。最后发现该村民在其中一个城市有一个远亲，于是确定该村民的信来自那个远亲。基本不认为是来自局部原始突变，因为突变的概率低于遗传，除非别的地方没有“1”型。

如果这个村民收到的是“红1”型呢？根据世界上从未报道过“红1”型的记载，这个“红1”型一定是来自本村的“红1”型变异，而不是来自外面的“红1”型，因为只有这个村报道过“红1”型，其他地方没有出现过这个变异。事实上，这种说法存在逻辑漏洞。有可能外面的“红”型有“1”突变，而这个“红1”型刚来，也有可能是外面“1”型的突变。为什么不考虑这些可能性呢？概率！这种情况发生的概率极低，基本不可能发生。为什么概率极低？比如“1”型的数量很少，从“1”型突变到“红1”型的概率自然低于从“红”型突变到“红1”型的概率。

总之，我们可以根据目标字母的基因序列，现有字母的种类、数量和地理分布，以及人类的社会关系来判断目标字母的传播路径。这种方法也可以用来分析新冠肺炎的传播。为了更准确地确定传染源，我们需要一个数据库，收集的信息包括：世界范围内新冠肺炎的遗传类型、类型间的遗传变异关系、每种类型出现的时间、数量和地理分布、人群的社会流动信息等。

字母模型展示了新冠肺炎的传播和变化特征。这个模型有一些缺点：字母的基因序列(字母文本序列)太短，不超过300个信息位，而新冠肺炎的基因序列要长得多，达到30000个信息位，所以病毒变异体之间的关系比字母变异体之间的关系复杂得多。还有，字母的基因是用人类的文字来表达的，其中包含了人类能够理解的语义。对于人类来说，似乎原始人的类型很容易确定。然而，新冠肺炎的基因序列对人类来说是不可读的，并且很难确定其原始类型。根据两种病毒的总信息，很难确定谁是父亲，谁是儿子，谁是第一个，谁是最后一个。

当然，新冠肺炎溯源基因序列的检测和比对是新冠肺炎溯源的主要手段，至少需要基因技术来做出最终判定。没有基因对比就做出的判断的正确性是无法保证的。如果要求特勤局确定新冠肺炎的来历，那会让人发笑。

武汉最先公布了新冠肺炎的基因序列，但这一事实并不能证实武汉就是新冠肺炎的起源点。它可能在世界其他地方已经存在很久了，但是没有被测试过，或者测试过但是没有发表。在武汉公布后，其他地方也相继公布了新冠肺炎的出现，但也许是后来公布的病毒在基因世代上比武汉高，意味着比武汉出现的病毒更早。

美国的电子烟肺炎是个谜。早在新冠肺炎宣布前几个月，这种肺炎就在美国流行，其表现与新冠肺炎相同。奇怪的是，在医学高度发达的今天，人们并不知道电子烟肺炎的致病机制，因为美国知道，但人们不公布。此外，美国同时爆发了“疫情流感”。这比电子烟肺炎有进步。我来告诉你为什么，是“疫情流感”，但是流感病毒也是病毒，可以检测基因序列，然后美国还是没有公布。

美国的Sao行动远不止这些。在新冠肺炎疫情爆发的早期，人们实际上退出了世界卫生组织！也许我担心世卫组织会问电子烟肺炎和大规模流感！

也许新冠肺炎的起源最终是皇帝的新装。大家都知道怎么回事，但是不敢说实话。毕竟，萨姆一手拿着导弹，一手拿着美元。谁惹他，谁就有麻烦。从搞政治的萨达姆、卡扎菲，到搞经济的阿尔斯通高管皮耶鲁奇、华为高管孟晚舟，从搞真相的斯诺登、阿桑奇，到搞正义、想调查美军人权犯罪的国际人权组织。类似的例子数不胜数，但他们的经历却因为名气大而广为人知。

也许，新冠肺炎的起源永远不会被揭露，就像肯尼迪总统遇刺的真相一样。不得不说，地球上真的有一个神奇的国度，让相信科学的人都觉得神奇。

基因测序如何确定病毒或细菌的来源？目前，它是由新冠肺炎解释的。首先，病毒的体外活性其实与病毒的种类和外界环境因素有关。看来病毒的起源和它在体外的灭活没有必然联系。因为病毒不能形成化石，复制机制复杂，所以研究病毒的起源非常困难。事实上，它们可以感染几乎所有的生物，这使得问题变得更加复杂。

有些病毒，如疱疹病毒和单核细胞增多症病毒，与它们宿主细胞的基因有一些共同的特征，这可能表明它们起源于细胞中的DNA，然后独立出来，或者它们可能起源于非常非常早，它们的一些DNA已经嵌入宿主细胞的基因组中。一些感染人类的病毒与能感染细菌的病毒有结构上的相似性，这可能表明这些病毒起源于数十亿年前。

这还涉及到另一个寻求病毒起源的问题。大多数现代病毒是由不同来源的位点或序列引起的，孩子们精心安排组成，以混合的方式形成一个个体。比如埃博拉病毒、马尔堡病毒等致命病毒：只有有限数量的物种可以远离并引发麻疹和狂犬病，这可能表明这些病毒相对年轻，因为它们的宿主种群在进化中必须是年轻的。

这些新病毒可能起源于数百万年前的昆虫，它们感染其他物种的能力是在进化过程中的某个时刻发展起来的。可能是这些物种与昆虫相互作用，或者以昆虫为食。虽然他们有许多病毒，但他们可能有许多共同的特征和复制和传播其基因组的特殊能力，但大多数病毒的起源可能永远不会被揭示。

今天到此为止。如果你有其他不同的想法和看法，可以在下面的评论区分享你的个人观点。喜欢我的可以关注一下。最后祝大家一切顺利。

追根溯源，新冠肺炎最初来自哪里？根据华南农业大学发表的研究成果，穿山甲携带的一种病毒与新型冠状病毒高度相似，序列一致性高达99%。如此高的相似性意味着新冠肺炎的中间宿主可能是穿山甲。

如果穿山甲是可能的中间宿主，那么它们身上的病毒最初是怎么来的？

对于新冠肺炎的溯源，可以参考当年的SARS冠状病毒。两种病毒都是冠状病毒，两者的序列相似度为79.5%。据分析，SARS病毒是由果子狸传染给人类的。但是，果子狸不是传染源，而是中间宿主。

中国病毒学家史经过多年追踪，终于发现在一个偏僻的蝙蝠洞可以找到SARS病毒的基因序列，而生活在那里的中华菊蝠很可能就是SARS病毒的原始来源。蝙蝠先将一种冠状病毒传染给果子狸，然后病毒在果子狸体内发生变异，使其能够感染人类，最终成为SARS病毒。

有了以前的经验，当追溯新冠肺炎的起源时，科学家们很自然地又想到了蝙蝠。根据史研究组的基因测序结果[1]，蝙蝠冠状病毒TG13与的序列相似性达到96.2%。因此，蝙蝠身上的冠状病毒也可能是新冠肺炎的源头。

蝙蝠携带大量病毒。埃博拉病毒、MERS病毒、狂犬病病毒、SARS病毒等病毒都被认为来自蝙蝠。但是蝙蝠体内有很多DNA修复基因，可以抑制其中的病毒，所以携带很多病毒的蝙蝠往往不会生病。

蝙蝠冠状病毒TG13与新冠肺炎在S1受体结合域的序列相似度没有那么高，这意味着蝙蝠冠状病毒很难直接感染人类。蝙蝠冠状病毒需要在中间宿主中发生基因变异，比如基因重组，这样它们会变得更容易被人类感染。

新冠肺炎传播过程中，蝙蝠接触到穿山甲等潜在中间宿主，蝙蝠身上的冠状病毒跨种族传播到穿山甲身上，不断变异进化。当人类接触到这些被感染的穿山甲时，变异的冠状病毒可能会侵入人体细胞，从而感染人类，成为此前未知的新冠肺炎。

总之，野生动物是新冠肺炎和大量其他病毒的天然和中间宿主。只有拒绝捕杀和食用它们，才能从源头上遏制病毒的传播。

参考

[1]郑-等，发现一种与近期人类肺炎暴发有关的新型冠状病毒及其潜在的蝙蝠来源，bioRxiv，2020，DOI:10.1101/2020.01.22.914952。